Бактериите са едноклетъчни растителни организми, които не образуват хлорофил и подобно на гъбите се хранят с готови органически вещества от тъканите на растенията и животните. Размножават се чрез просто деление на клетката. В растенията проникват през устицата и през рани. Те причиняват паразитните болести, наречени бактериози. При голяма част от фитопатогенните бактерии тялото е покрито с реснички, посредством които се придвижват в течна среда. Развиват се при висока температура, но могат да презимуват в почвата и в растителните остатъци. Пренасят се с поливни води, с дъждовни капки, чрез семена, калеми, резници, клубени, насекоми, почва, птици, работен инвентар, ръцете на работниците и др.

Характерни признаци за бактериози по растенията е появата на маслени петна по листата, които по-късно прегарят и изсъхват, петна с определена форма и цвят по плодовете и семената, увяхване и загиване на цели растения, мокро гниене, образуване на гали и тумори и др. За борбата срещу тях се използват фунгициди.

Вирусите нямат собствен обмен на веществата

Вирусите също причиняват болести по растенията. Те са белтъчни молекули - нуклеопротеини, с малки частички, невидими да просто око. Вирусите са вътрешноклетъчни паразити - развиват се само в живите клетки. Те нямат клетъчен строеж и собствен обмен на веществата, но притежават изключително голяма способност да се размножават в клетките на заразеното растение и да възпроизвеждат подобни на себе си вирусни частици. Вирусната инфекция обхваща всички тъкани и органи на растението. Веднъж заразено растението остава източник на зараза до края на живота си.

Най-честите признаци на вирусните заболявания са: изменение на нормалния зелен цвят на листата в жълто-зелен, било на петна или в междунервията, накъдряне, завиване на листата, изменения на стъблото и други. Самите болни растения са силно закържавели, с деформирани листа, цветове и плодове, или  покрити със сухи петна от загнила тъкан.

Пренасянето на вирусите от болно на здраво растение става чрез насекоми със смучещ и пробивно-смучещ устен апарат - листни въшки, цикади, трипси, белокрилки. Могат да се пренасят и с вегетативните части на растенията, използвани за размножителен материал. Малък брой вируси се пренасят със семената на болните растения. Заразяване може да стане и при различни манипулации при отглеждане на  растенията. Преносители са и някои видове нематоди и почвени гъби.

Същият тип повреди по растенията могат да причинят и микоплазмите. Те са едноклетъчни микроорганизми, без хлорофил и без твърда клетъчна стена. Имат собствен обмен на веществата и се смятат за едни от най-примитивните организми.

Опасни паразити по растенията са и някои висши растения - кускутата, синята китка, имелът и др. Те нямат хлорофил и не могат да се хранят самостоятелно, а смучат сокове от  растенията.